土壤：生物有机肥可调理土壤，预防土壤板结，增强土壤的透气性及保水保肥能力，同时可以提高土壤肥力，减少化肥使用量，提高作物产量。
作物：生物有机肥可增强作物的抗病及抗逆能力，促使作物茎杆粗壮，叶色浓绿，并提前开花，提高作物坐果率，同时可提高农产品含糖量及维生素含量，确保农产品色泽鲜艳、个头整齐、成熟集中。
一、生物有机肥的功效
1、生物有机肥可以调理土壤、克服土壤板结、增加土壤空气通透性、能减少水分流失与蒸发、减轻干旱的压力、保肥、减少化肥、减轻盐碱损害。
2、在减少化肥用量或逐步替代化肥的情况下，提高土壤肥力，使粮食作物、经济作物、蔬菜类、瓜果类大幅度增产。
3、提高农产品品质、果品色泽鲜艳、个头整齐、成熟集中，瓜类农产品含糖量、维生素含量都有提高，口感好，有助于扩大出口，提高售卖价格。
4、改善作物农艺性状、使作物茎杆粗壮，叶色浓绿，开花提前，坐果率高，果实商品性好，提早上市时间。
5、增强作物抗病性和抗逆性、减轻作物因连作造成的病害和土传性病害，降低发病率，对花叶病、黑胫病、炭疽病等的防治都有较好的效果，同时增强作物对不良环境的综合防御能力。
二、生物有机肥的特点
1、生物有机肥营养元素齐全，可以改良土壤，改善使用化肥造成的土壤板结。改善土壤理化性状，增强土壤保水、保肥、供肥的能力。
2、生物有机肥中的有益微生物进入土壤后与土壤中微生物形成相互间的共生增殖关系，抑制有害菌生长并转化为有益菌，相互作用，相互促进，起到群体的协同作用，有益菌在生长繁殖过程中产生大量的代谢产物，促使有机物的分解转化，能直接或间接为作物提供多种营养和刺激性物质，促进和调控作物生长。提高土壤孔隙度、通透交换性及植物成活率、增加有益菌和土壤微生物及种群。
3、同时，在作物根系形成的优势有益菌群能抑制有害病原菌繁衍，增强作物抗逆抗病能力降低重茬作物的病情指数，连年施用可大大缓解连作障碍。减少环境污染，对人、畜、环境，是一种环保型肥料。
三、生物有机肥怎么用
1、种施法：机播时，将颗粒生物有机肥与少许化肥混匀，随播种机施入土壤。
2、撒施法：结合深耕或在播种时将生物有机肥均匀地施在根系集中分布的区域和经常保持湿润状态的土层中，做到土肥相融。
3、其它常用的施肥方式还有：条状沟施法、环状沟施法、放射状沟施、穴施法、蘸根法、盖种肥法等。