概念不同：蜂巢是蜜蜂生存居住的场所，蜂蜡是适龄工蜂分泌的脂肪性物质。
作用不同：蜂巢的主要用于是储存食物和哺育幼虫，蜂蜡主要用于建造蜂巢。
成分不同：蜂蜡的主要成分是脂类、酸类等，蜂巢是蜂蜡、蜂蜜等的集合体。
功效不同：蜂蜡有抗菌消炎、去腐生肌的效果，蜂巢有增强免疫力、降脂降压等功效。
一、概念不同
蜂蜡和蜂巢是两个不同的概念，简单来说蜂巢是蜜蜂的家园（蜜蜂无论生存还是繁殖都需要蜜蜂窝），蜂蜡是蜂群中适龄工蜂（13~18日龄）分泌的脂肪性物质，但蜜巢和蜂蜡之间有必然的联系。因为蜜巢的主要成分是蜂蜡，在养蜂生产中养蜂人会将淘汰的老旧巢脾融化后提炼蜂蜡。
二、作用不同
蜂巢是蜂群生存繁衍的必需品，因为无论是储存食物（蜂巢用巢房储存蜂蜜或花粉）还是哺育幼虫（蜜蜂在巢房里育虫）都需要蜂巢，而蜂蜡的主要作用是建造蜂巢（蜂巢的主要结构是巢脾，而巢脾是由巢房组成的，而巢房是由蜂蜡组成的），从这一点来看，蜂巢和蜂蜡的区别类似于砖和房子。
三、成分不同
蜂蜡和蜂巢在成分上有很大的不同，其中蜂蜡的主要成分是脂类、酸类、酒精类和烃类，还含有少量挥发油、着色素、矿物质和芳香物质等成分，蜂巢是蜂蜡、蜂蜜、蜂胶、蜂花粉、蜂茧衣的集合体，即蜂蜡所含的所有成分都存在于蜂巢中。
四、功效不同
蜂蜡和蜂巢在效果上的差异非常显著，蜂蜡的主要效果是抗菌消炎、去腐生肌，因此多用于鼻炎、咽炎等呼吸道炎症及烧伤、烫伤等外部创伤，蜂巢的主要效果是增强免疫力、抗菌消炎及降脂降压，特别适合于免疫低下、体弱多病、局部炎症及高血压、高血脂、高血糖等患者保健食用。