选用合适的育苗介质。辣椒喜欢肥沃、疏松、透气、排水良好的土壤。因此，在育苗时应选用具备这些特质的育苗介质。同时，要注意育苗介质的pH值，适宜的pH值为6.0-7.0。
控制育苗箱内的温度和湿度。在湿度方面，辣椒适宜在60%-70%的湿度下生长。在温度方面，不同的辣椒品种需要的温度有所不同，一般而言，最适宜的温度为20℃-28℃。需要注意的是，育苗箱内的温度和湿度应该保持稳定，避免出现剧烈波动。
注意育苗箱内的通风。辣椒在生长过程中需要氧气和二氧化碳的交换，因此，育苗箱内应该有足够的通风。通风的时间和强度应该根据室温和湿度而定，以保持育苗箱内的稳定环境。
适时施肥。在辣椒育苗的过程中，适量施入适量的肥料是非常必要的。为了避免肥料对幼苗造成伤害，应该选用浓度适中的肥料，并且在施肥后要及时浇水，将肥料稀释掉。
注意病虫害防治。在辣椒育苗的过程中，病虫害也有可能会出现，因此，应该注意对病虫害的预防和治疗。在育苗过程中，可以选择使用生物农药防治病虫害，这种方法比较安全、环保，对幼苗的伤害也比较小。