早期预防，种子处理，农事操作时及时喷药。
选择抗病品种，测土配方施肥，培育抗病健株，预防为主，进行综合防治。
加强检疫和管理，实行秋季深翻地。
预防西瓜细菌性果斑病种子处理是关键。可以用中国农业科学院植物保护研究所研制的种子处理剂“杀菌剂1号”，效果较好。
细菌性病害用农用链霉素效果较好。
早期预防，种子处理，农事操作。
发病初期可选用20%噻菌铜悬浮剂500倍液，或20%叶枯唑可湿性粉剂500倍液，或72%农用链霉素可溶性粉剂4000倍液，或47%春雷·氧氯铜可湿性粉剂800倍液进行防治，每7天喷一次，连续喷2～3次。
种子高温处理或用硫酸链霉素。
加强检疫和管理，培育抗病健株，预防为主，可用链霉素效果好。
西瓜得了病，可用杀毒药品进行防治。