1、近年该病上升与部分育种材料抗病性差，耕作栽培条件改变有很大关系。因此，选用抗病品种是首要防治措施。2、加强栽培管理，合理施肥，合理密植，降低土壤湿度等，可以使植株健壮，减少茎腐病。3、合理轮作，深翻土地，清除病残，不施用未腐熟有机肥，可以减少田间菌源，达到一定的防治效果。4、及时按包装说明浓度喷多菌灵或恶霉灵，或甲基托布津等。
（1）农业防治。采用高畦栽培，不宜沟灌；及时排水和清除病株。（2）培育壮苗。种子和营养土严格消毒；出苗后喷施0.1%磷酸二氢钾或植宝素8000倍液；苗期发病用75%百菌清可湿性粉剂600倍液或50%福美双可湿性粉剂500倍液喷雾。