养分流失受施肥量、施肥时间、降雨量、降雨强度等因素影响。施肥量越高，养分流失的风险就越大；降雨量越大、降雨强度越高，养分流失量就越大。施肥后一周内是养分流失的高风险期，一周以后则风险较低。因此，根据养分流失的发生规律，制定科学合理的施肥方案，优化现有施肥技术和方法，尽量从源头上减少面源污染物的发生和排放，将化肥施用对环境的负面影响降到最低。常见的技术包括测土配方施肥、施用缓控释肥料、添加肥料增效剂、有机肥部分替代化肥、水肥一体化、机械深施和按需多次施肥等技术。
测土配方施肥是以土壤测试、肥料田间试验、农户调查为基础，根据作物需肥规律、土壤供肥性能和肥料效应，在合理施用有机肥料的基础上，提出氮、磷、钾及中、微量元素等肥料的施用数量、施肥时期和施用方法。
缓控释肥技术是指通过包膜等各种调控机制降低或控制肥料中养分的释放速度，使其与作物的养分需求相吻合。施用缓控释肥配合机械深施技术，可显著提高肥料利用率，降低养分流失。
通过有机肥部分替代化肥，有机无机配合施用，可以减少农田中化肥的投入，在实现减投减排的同时还能培肥土壤肥力。
采取水肥一体化或机械侧深施肥等方式进行施肥，可在减少氮肥投入20%～30%的基础上维持作物产量稳定，显著提高氮肥利用率，减少氨挥发损失。