向日葵黑斑病与雨水有直接关系，高温多雨年份发病重。连作地、播种早的向日葵易发病。
气流传播到向日葵植株上进行初侵染。侵入适温25～30℃，在雨季，温度适宜，寄主处于乳熟至腊熟期很易发病。高温多雨该病流行速度快，潜育期短，因此很易流行成灾，成为生产上的重要病害。
1)选用抗病品种如辽葵杂3号等。(2)秋季深翻地，消灭病残体，减少初侵染源。(3)采用向日葵配方施肥技术，施足底肥，增施磷钾肥提高抗病力。(4)种子处理用50%福美双或70%代森锰锌可湿性粉剂按种子量的0.3%拌种，也可用60℃热水浸种10分钟。(5)药剂防治发病初期及时喷洒70%代森锰锌可湿性粉剂400～600倍液或75%百菌清可湿性粉剂800倍液、50%异菌脲(扑海因)可湿性粉剂1000倍液，隔7～10天一次，喷2～3次。