菌种是获得食用菌丰产的基础与保证，菌种的好坏直接影响食用菌生产的经济效益。选购食用菌良种要注意以下问题。
一、看准市场选品种。不同地区、不同季节、不同年份食用菌价格均有差别。菇农选种不能墨守陈规，要随机应变，从以下几个方面入手。
１．选择价格好的品种，如蘑菇中“２７９６”，平菇ｐ５４“新世纪”、小平菇及草菇ｖ２３、ｖ３５等品种，通常成品供不应求且价格高，能以价取胜，特别适合城郊发展。
２．选择高产优质品种，其以质量与产量取胜。这些品种在上市高峰期仍能获得较高的经济效益，比较适合外运的大型食用菌基地发展。
３．选择新优品种。“物以稀为贵”，一些珍稀新优品种如杏鲍菇、茶新菇、白灵菇、真姬菇等可以规模生产，其价格贵，经济效益好。但选择时必须掌握其特性及配套的栽培技术。
二、选择品种要“三看”。当前市场上仍存在许多假劣菌种，使消费者真假难分，容易受骗。因此，选择优良菌种要做到“三看”：
１．看单位。要选择信誉度高、经济实力强、技术力量雄厚的单位购种。不能单纯追求价格便宜，否则容易上当，因小失大，造成不必要的经济损失。
２．看品牌。要选择你所熟悉的品牌，不能盲目轻信广告，如转化率达４５０％、５００％，抗一切杂菌，成功率达１００％等，均是故意炒作的说法，不能轻信。
３．看菌种。菌种具有一定的外观特征，很多菌种从外观上可以判断其质量及新陈程度。购种者要学会观察菌种的特征，善于辨别菌种的好坏与新陈。
三、舍得花钱购良种。种植食用菌经济效益差距很大，如５吨栽培料产值高的可上万元，低的只有几百上千元，有的甚至会亏本。而如能舍得投资，购买精品菌种，其实能在一定程度上保证高产优质，降低投资风险。