幼苗发病，子叶上有水渍状暗绿色圆形斑，后中央逐渐变成红褐色，在近地面的茎基部发病，初现暗绿色水渍状病斑，后病部逐渐缢缩，生长点及嫩叶迅速萎蔫，致使幼苗青枯而死。
子叶上有水渍状暗绿色圆形斑。
疫病疫菌可侵染幼苗、茎、叶、果实。茎叶染病时产生椭圆形或不规则形褐斑，形成水渍状软腐，病部可见灰白色霉状物。果实被侵染初期为暗绿色水渍状小点，后扩展，停止生长，产生灰白色霉状物，腐烂。
南瓜发疫情可侵染幼苗，茎，叶片。果子。
南瓜茎、叶、果均可染病。茎蔓部染病，病部凹陷，呈水浸状，变细、变软，致病部以上枯死，病部产生白色霉层。叶片染病初生圆形暗色水渍状斑，软腐、下垂，干燥时呈灰褐色，易脆裂。果实染病初生大小1厘米左右凹陷水渍状暗色至暗绿色斑，后迅速扩展，并在病部生出白色霉状物，菌丝层排列紧密，难于切取，经2～3天或几天后果实软腐，在成熟果实表面上有的产生蜡质物，生产上果实底部虫伤处最易染病。
疫病疫菌可侵染幼苗、茎、叶、果实。