鸡传染性喉气管炎的病理变化主要表现为气管和喉部的炎症反应。病毒感染后，在短时间内引起气管和喉部黏膜的水肿、充血和坏死。病变区域呈现红色、充血的外观，有时会伴随有脓液和坏死组织的形成。
鸡传染性喉气管炎还会导致气管和喉部的上皮细胞损伤和脱落。病毒感染后，上皮细胞会出现变性、肿胀和破裂，导致上皮细胞的脱落。这会进一步导致气管和喉部的黏膜表面变得不平整，失去正常的保护屏障功能。
鸡传染性喉气管炎的病理变化还包括病原体的扩散和淋巴器官的病变。病毒通过空气传播以及直接接触方式传播，从而引起呼吸道感染。感染后，病毒会侵入淋巴组织，导致淋巴结的充血和增大。这些淋巴结中可能存在病毒颗粒，并且可以成为病毒的潜伏场所。
鸡传染性喉气管炎的病理变化还包括免疫反应的参与。感染后，鸡的免疫系统会产生一系列的免疫反应，包括白细胞的浸润和炎症介质的释放。这些免疫反应有助于清除病毒，但也可能导致炎症反应进一步加剧，加重组织损伤。