玉米青枯病主要发生在生长后期，叶先青枯，茎基部3—4节干缩糜烂，根部空心变软，皮层变紫红或褐色，易剥离，严重时病株失水萎蔫枯死。发病率通常在10%—15%，高者可达30%以上。该病主要在玉米生长前期侵染，故防治宜早不宜迟。
选用抗病品种种植抗病品种是一项最经济有效的防治办法。近几年培养的鲁单50、鲁单981、农大3138、豫玉22号等玉米良种，既高产，又抗病，可在生产上推广种植。
轮作换茬在同一地块中连年种植玉米，可造成病原菌在泥土中大批积攒，发病会逐年加重。如果与大豆、花生等非寄主作物履行轮作，可显然减轻病害的发生。使用包衣种子种子包衣剂中含有杀菌成分及微量元素，既能抵挡病原菌侵染，又能增进幼苗生长，加强抗病能力。种衣剂用量为种子量的1/40—1/50。
施用锌、钾肥玉米青枯病病菌属弱寄生菌，在玉米中后期生长瘦弱时才大批发病。施用锌、钾肥可使玉米茁壮生长，能大幅度提高玉米的抗病能力，下降发病率。方法是：玉米幼苗期每1/15公顷用锌肥1。5—2千克、钾肥10—15千克，混杂后穴施于玉米茎基部7—10厘米处。
浇药水玉米生长中后期发现零碎病株时，可用甲霜灵400倍液或多菌灵500倍液浇根，每株灌药液500毫升，有较好的治疗效果。