菌丝穿过花盘在籽实之间蔓延，最后形成网状黑色菌核，花盘内外均可见到大小不等的黑色菌核，果实不能成熟。
向日葵菌核病又称白腐病，病菌可侵害向日葵植株的所有部分，发病常伴有根腐、茎腐、叶腐、花腐症状，危害根部、茎杆、花盘。春季以根腐型、茎基腐型为主；秋季以盘腐型为主。
整个生育期均可发病，造成茎秆、茎基、花盘及种仁腐烂。常见的有根腐型、茎腐型、叶腐型、花腐型4种症状，其中根腐型、花腐型受害重。根腐型从苗期至收获期均可发生，苗期染病时幼芽和胚根生水浸状褐色斑，扩展后腐烂，幼苗不能出土或虽能出土，但随病斑扩展萎蔫而死。