黄瓜炭疽病病菌以菌丝体和拟菌核随病残体遗落在土壤中越冬，菌丝体也可潜伏在种皮内越冬。冬季温室也为病原菌越冬提供了重要场所。
孢子萌发的最适温度为22-27℃，病菌生长的最适温度为24℃，在高温高湿条件下，病菌自侵入到表现症状只需3天，相对湿度在54%以下，病害不能发生。早春塑料棚温度低，湿度高，叶面结有大量水珠，黄瓜吐水、叶面结露，发病的湿度条件经常处于满足状态，易流行。露地条件下北方7-9月，低温多雨条件下易发生，气温超过30℃，相对湿度低于60%，病势发展缓慢。此外，重茬、偏施氮肥、浇水过多、排水不良地块易发病。