叶片：病斑近圆形或呈放射状，病斑周围有明显的边缘，老叶上更为明显；初期叶上生绿褐色霉层，稍后霉层渐变为褐色至黑色。严重时病斑布满全叶，叶片会变小、变厚，叶片枯焦，呈卷曲或扭曲状，易早期脱落。叶柄：病斑呈长条形而促使早期落叶。果实：从幼果至成熟果均可受侵害。病斑初为淡黄绿色、圆形或椭圆形，渐变褐色或黑色，表面生绒状霉层。随着果实生长膨大，病斑渐凹陷，硬化、龟裂；病果较小。果实染病较早时，发育受阻而成畸形。果实在深秋受害时，病斑小而密集，黑色或咖啡色，角质层不破裂。花序:病菌可侵害花瓣、萼片的尖端使其褪色；花梗被害后呈黑色,造成落花落果。
苹果黑星病主要危害叶片和果实。叶片上病斑近圆形或呈放射状，初期叶上生绿褐色霉层，稍后霉层渐变为褐色至黑色。严重时病斑布满全叶，叶片枯焦，易早期脱落。果实发病，幼果和成熟果都可受侵害，病斑初为淡黄绿色，圆形，后期褐色或黑色，表面有绒状霉层，病斑凹陷，硬化龟裂。
叶片染病，先从叶正面产生褐色霉层，发病后期，许多病斑连在一起，致使叶片扭曲变畸，并出现大量落叶。果实染病，从幼果至成熟果都可受侵害。病斑多发生在肩部或胴部，初为淡黄绿色斑点，渐变褐色至黑色，表面产生黑色绒状霉层。随果实生长，病斑逐渐凹陷、硬化，常发生星状开裂。幼果染病，因发育受阻而多形成畸形果。
黑星病菌主要侵染苹果叶片和果实，也可侵染叶柄、花、萼片、花梗、幼嫩枝条和芽鳞等，严重时造成落叶、落果，受害果实开裂畸形，直接影响苹果的产量、品质及商品价值。
苹果黑星病可以使叶、叶柄、嫩梢、花、果实、果梗等受害。以叶片、果实受害严重。叶片正背两面病斑近圆形，大小不等，有烟煤状霉，即病菌的分生孢子梗及分生孢子。病斑边缘因菌丝在角质层下放射状扩展，呈细碎的冰纹状。重病叶缩小，变厚扭曲，变黄早落；果斑淡黄绿色，圆形，渐扩大，凹陷，随果实长大而硬化。表面有裂纹，生烟煤状霉。