刚出土的幼苗及大苗均能受害，通常多发生在育苗的中后期。受害幼苗茎基部产生椭圆形暗褐色病斑，逐渐凹陷，边缘明显。发病早期病苗白天中午萎蔫，夜晚和清晨能恢复。当病斑扩大绕茎一周后，病部收缩干枯，整株死亡。由于病苗大多直立而枯死，故称为“立枯”。湿度大时病部产生不太明显的蛛丝状霉，后期形成微小的菌核，可区别于猝倒病菌的白色棉絮状霉。
甜瓜立枯病为甜瓜苗期害病，个别年份此病危害相当严重。病情较轻，多在温度较高的苗棚零星发生，造成局部死苗。甜瓜苗期染病引起立枯病。成株期染病主要危害果实和近成熟果实，初在靠近土面处果实上发病，产生不规则形褐斑，湿度大时病部长出白色菌丝。