过量的使用除草剂可能会直接造成农作物的要害，同时除草剂会残留在土壤影响下茬作物的正常生长。
除草剂引起农作物叶斑，畸形，死亡，停长等。
过量使用除草剂对玉米、小麦、大豆产生药害和隐形药害危害，抑制作物生长，降低作物产量。
除草剂的危害有：使农作物的营养成分含量降低，从而导致粮食中所含的某一营养成分缺失；导致自然植被遭到不同程度的破坏，有些物种还很有可能遭到灭绝；危及人畜，使人畜的患病机率严重增加。
在使用除草剂的时候，要掌握正确的方法，不然对作物是有危害的。苯氧羧酸类的危害就是使其停止生长，并且还会出现落花的现象。二苯醚类的危害是叶子会枯焦，也不容易长出新叶。酰胺类的危害是黄叶，严重的会卷曲且出现斑点，还有可能会死亡。杂环类的危害是植株枯黄、死亡。
除草剂使用易对作物产生药害，影响作物产量。
苯氧羧酸类的危害就是使其停止生长，并且还会出现落花的现象。二苯醚类的危害是叶子会枯焦，也不容易长出新叶。酰胺类的危害是黄叶，严重的会卷曲且出现斑点，还有可能会死亡。杂环类的危害是植株枯黄、死亡。
容易产生药害，使农作物收到损失。
如果残留量过多不仅影响生长，还会导致死亡。
除草剂施用不当会造成药害，伤害植株；有的除草剂残效期长还会使下茬作物产生药害。