病菌在种子或在病残体上或在种株上越冬。带病的种子播种后有时被害而不能出苗；有时出苗后，病菌由幼苗子叶叶缘水孔侵入，常常导致幼苗发病死亡。病残体上的病菌遗留在土壤中可存活1年以上，当病残体腐烂之后不久，病菌即死亡。
甘蓝黑腐病是由甘蓝黑腐黄单胞杆菌侵染引起。病菌在种子或在病残体上或在种株上越冬。带病的种子播种后有时被害而不能出苗；有时出苗后，病菌由幼苗子叶叶缘水孔侵入，常常导致幼苗发病死亡。病残体上的病菌遗留在土壤中可存活1年以上，当病残体腐烂之后不久，病菌即死亡。田间通过雨水、灌溉水、昆虫、农事操作等传播病菌。病菌从虫伤口或从叶缘的水孔侵入，先在薄壁细胞内，后进入导管，再向上向下蔓延，造成系统性侵染。种株被害后，病菌由果柄的导管侵入，再进入果荚和种脐，致使种子内部带菌；病菌也可附在种子上，造成种子外部带菌。此外，带菌的粪肥，也可传播病菌。
病原菌甘蓝黑腐病是由甘蓝黑腐黄单胞杆菌侵染引起。茵体呈杆壮，无芽孢，有荚膜，有极生鞭毛1根。革兰氏染色呈阴性。