注意蚜虫飞虱，青虫危害喷施功夫，甲维盐防治。
芝麻病虫害主要有芝麻茎点枯病、枯萎病、病毒病、叶斑病、地下害虫、蚜虫和蛀蒴害虫。
芝麻苗期发作枯萎病和疫病，每亩可用50%叶枯灵可湿性粉剂0.5公斤，拌湿润细土20公斤，条施沟底（土壤消毒），然后耕种。
芝麻的病虫害虽然种类很多，但各种病虫害发生频率和危害程度不一样。就病害而言，在十几种芝麻病害中，发生最多、为害最重的主要是芝麻茎点枯病、枯萎病和病毒病以及叶斑病。茎点枯病、枯萎病造成大量死苗，病毒病引起萎蔫至死亡，叶斑病造成植株早衰、落叶，影响高产潜力的发挥和粒重的提高。
芝麻病虫害有茎点枯病、枯萎病、青枯病、立枯病、疫病、病毒病、小地老虎、蚜虫、甜菜夜蛾、芝麻天蛾、盲蝽等。