肉鸡免疫接种及程序应依据饲养的种类、品种、数量、饲养条件等多方面因素而定，就一般饲养商品肉鸡用户而言，以下免疫程序可供参考。
免疫程序
1日龄颈皮下注射马立克氏疫苗，7日龄新城疫IV系一传支120二联苗滴鼻点眼，14日龄传染性法氏囊疫苗滴鼻或点眼，21日龄传染性法氏囊疫苗二次饮水免疫，28日龄新城疫IV一传支120二联苗二次饮水免疫。52-56日龄出栏，成活率达94%以上。
注意事项
在免疫接种疫苗之前，必须了解鸡群健康情况，鸡在患病期间禁止接种疫苗。
疫苗接种前后3天内，饮水中应加抗应激类药品，如电解多维、延胡索酸等，以缓解鸡群接种疫苗产生的不良反应。
进行免疫接种前后3天内，应禁止给鸡舍消毒、给鸡群喂药，避免影响免疫效果。
疫苗免疫剂量应按照说明书上规定进行，不可过多或过少，否则均会影响免疫效果。
稀释疫苗不宜使用金属用具，疫苗稀释后应放置阴凉处，避免日光照射，稀释好的疫苗应立即使用，并于2小时内用完。
鸡群使用滴鼻、点眼免疫时，滴后应停1-2秒后再放鸡，以确保药液被吸收。
饮水免疫的用水可选用蒸馏水、冷开水或清洁的深井水，不可使用自来水或含重金属离子及消毒剂的水。饮水添加0.1-0.2%的脱脂奶粉免疫效果极佳。在饮水免疫前应停水一定时间，一般2-4小时。应根据舍内温度适当调整，饮水免疫应有足够饮水器，以保证2/3的鸡都能同时饮水。含有疫苗的水应在1-2小时内饮完，饮完之前不要添加任何水。饮水免疫后，应对饮水器消毒处理。