在水稻孕穗后到抽穗扬花期，每亩使用3%井冈霉素可湿性粉剂150克，兑水30千克叶面喷雾。或者使用50%多菌灵可湿性粉剂100千克，兑水30千克，叶面喷雾。重病水稻田，每周用药一次，连续2～3次。
水稻稻曲病用戊唑咪鲜胺、苯甲丙环唑等药剂喷雾防治。
可用戊唑咪鲜胺或苯甲丙环唑或井冈蜡芽孢杆菌喷施防治效果比较好。
在发生稻曲病之后，需要及时的进行防治，可以使用咪鲜胺核吡唑醚菌酯，这种药物对于这种病害有很好的治疗效果。
水稻稻曲病可用戊唑咪鲜胺防治。
加强水肥的田问管理，结合NPK配方施肥，综合病虫害防治。
水稻稻曲病用DT乳剂或苯醚甲环唑、井岗霉素防治效果比较好。