水是植物生长的命脉，高品质百合生长过程中对水分的要求非常严格。怎么才算给百合切花“喝”好了呢？常规来说，百合生产初期种球由于长时间的存储，消耗了很多水分和养分，下种之后的前三次浇水非常重要。实践证明，百合种植的前三次浇水是否及时和合适，将直接影响后期植株生长的高度。常规的方法是：百合种球下种当天要浇一次水，第一次浇水要浇透；第二次浇水在下种后的第三天，同样要求浇透，以利于种球和土壤的密切结合；第三次浇水时间是下种后的一个星期，仍要浇透。无论百合生产的土壤是什么条件，这三次浇水都必须进行。三次浇水的主要目的一是让长期处于脱水状态的种球进行水分补充，使其芽和根系能更好伸展；二是使种球和土壤紧密结合在一起。
当然，对于浇灌使用的水也有一定要求，水的pH值要求与百合生长的pH值匹配。浇灌用水的来源往往不一样，条件好的种植区应尽可能使用河水浇灌，也可以建造蓄水池，还有就是人为的用化学方法调节。北方地区的水质往往pH值偏高，在7.2至8.2之间，且伴有较高的盐分，对根系的伸展有不良影响，需要对水质进行一定的人为处理。改变水质的方法很多，如在浇灌时可以同时加入适量柠檬酸、草酸、磷酸等来改变pH值，具体用量根据实际情况进行调节。