一般根据猪大肠杆菌病的三种病症的发病日龄和临床表现即可对猪大肠杆菌病做出诊断鉴别。1.对仔猪黄痢进行诊断鉴别：仔猪黄痢最明显的症状是出生几小时到7日龄内的仔猪发病，仔猪拉黄色或灰黄色稀便。2.对仔猪白痢进行诊断鉴别：仔猪白痢最明显的症状是10-30日龄内的仔猪发病，仔猪拉白色或灰白色稀便，粪便有腥臭味。3.对猪仔猪水肿病作出诊断鉴别：仔猪水肿病的最明显的症状是断奶后的仔猪尤其是发育良好的仔猪突然发病，急性死亡；发病的主要特征是水肿和运动失调。再通过实验室方法病菌的分离与鉴定进行确诊。
猪大肠杆菌病的诊断：一般根据多发于3～7日龄左右的新生仔猪，且新母猪产的仔猪更严重;拉黄色水样粪便，发病率和致死率都高及高度脱水等特点，可做出诊断。
止痢、抗菌以及消炎作为基本原则，在猪仔发病的初期，可以肌注卡那霉素或是庆大霉素，一天注射两次。在发病中期可以口服硫酸新霉素，同时可以注射阿托品、恩诺沙星以及诺氟沙星治疗。
采取发病仔猪粪便(最好是未经治疗的)，或新鲜尸体的小肠前段内容物，接种于麦康凯或鲜血琼脂平板上，挑取可疑菌落作纯培养，经生化试验确定为大肠杆菌后，再作肠毒素或吸着因子的测定。
本病在世界各地均有流行。炎夏和寒冬潮湿多雨季节发病严重，春、秋温暖季节发病少。猪场发病严重，分散饲养的发病少。头胎母猪所产仔猪发病最为严重，随着胎次的增加，仔猪发病逐渐减轻。这是由于母猪长期感染大肠杆菌而逐渐产生了对该菌的免疫力。在新建的猪场，本病的危害严重，之后发病逐渐减轻也就是这个原因。新生24h内仔猪最易感染发病。一般在生后3天左右发病，最迟不超过7天。在梅雨季节也有生后12h发病的。头胎母猪产的仔猪最易发生本病，随着日龄的增长，发病率和致死率逐渐减少。