苗龄过长、砧木长时间处在高温环境中、喷洒过多的控旺药剂等因素都容易造成根部老化，吸收能力差，外界环境波动较大时，出现茎秆开裂现象。地温和浇水温差大、缺硼钙等也会造成茎裂。
幼苗根部老化、浇水不当、环境变化剧烈、硼钙等中微量元素吸收障碍、蔓枯病等病害侵染会造成西瓜苗茎秆开裂。
西瓜苗茎秆开裂一般有以下几方面的原因：1、幼苗苗龄过长根部老化；2、浇水不当、防风过急等使环境温度剧烈变化；3、缺硼缺钙等中微量元素；4、蔓枯病等病害侵染。防治措施：1、培育健壮幼苗适龄定植；2、均衡浇水保证环境温度不要剧烈变化；3、及时补充硼钙等中微量元素肥；4、提前喷施防病药剂预防病害。