玉米丝黑穗病发病原因很多，大致与使用感病品种及未腐熟的有机肥，连作，未处理的感病残株，温湿度等有关。
种植感病品种，连作、未处理的感病残株。
主要种植感病品种，抽穗期遇雨、密度大易感染黑穗病。
杂交玉米丝黑穗病发病的主要原因是气候。
玉米丝黑穗病是玉米生产上的主要病害之一。由于一些玉米品种的抗病性不强或致病菌的变异以及连续重茬栽培等原因,造成玉米丝黑穗病发生。
(一)感病品种的大量种植,是导致丝黑穗病严重发生的因素之一。(二)长期连作致使土壤含菌量迅速增加。(三)使用未腐熟的厩肥。(四)种子带菌未经消毒、病株残体未被妥善处理都会使土壤中菌量增加，导致该病的严重发生。(五)玉米播种至出苗期间的土壤温、湿度与发病关系极为密切。