小麦锈病的最佳防治方法可进行农业与药剂综合防治，挑选优良抗病小麦品种，加强水肥及田间管理，并选用粉锈宁或丙环唑等药剂进行防治。
小麦条锈病防治要做到早发现早防控。
1、种子管理。引进小麦种子时，可轮换选用抗（耐）病品种。2、栽培管理。指导麦区合理布局小麦品种，避免种植单一小麦品种，不单种具有垂直抗性的品种，应选种抗源类型不同的品种，减少病害的流行与蔓延。3药剂防治。71.5%吡奈·醚菌酯，具有保护、治疗和铲除三重功效。
种植抗病品种，种子包衣，药剂防治。
主要以预防为主，进行综合防治。
小麦条锈病可以粉锈宁进行防治。
小麦条锈病防治措施:(1)选用抗病品种,做到抗源布局合理及品种定期轮换。(2)药剂防治，在缺少抗病品种或原有抗病品种抗锈性丧失,又无接班品种的麦区,需要进行药剂防治。可选用杀菌剂有敌钠酸、敌锈钠、氟钡制剂、氨基磺酸钙、氟硅脲、萎锈灵、灭菌丹等兑水喷雾防治。
选用抗病品种、对种子包衣、用药剂进行防治等。
以预防为主，加强药剂防治。
选用抗病良种是防治小麦条锈病的基本措施。