播种前，苗床要一次浇透底水，一般17-20厘米深，待水渗下后，床上再铺上一层培养土，大约8-10厘米厚，用木条尺刮平，进行床土处理，按每平方米面积，用2-3克50%立枯}可湿性粉剂稀释1000倍液，充分喷湿培养土，待地面床土稍干后，即可按常规方法播种。本病多发生在苗期中后期，及时间苗、移苗，培育壮苗。
在幼苗后要注意多施磷钾肥，切忌偏施氮肥，以增强抗病能力。三、在阴雨时节，用干净纯净的草木灰撒施在辣椒茎基部，对防治茎基腐病有很好的效果。一般每株撒施250~300克左右为宜。喷洒杀菌剂：初期：降低地面温度，可在辣椒行间铺草，防止植株基部灼伤。开花结果期采用浸灌或浇水，不能漫灌，更不能久灌不排。